¡Si!
Podrás definir un usuario responsable para cada departamento para que pueda exportar un csv con los empleados del departamento e importar posteriormente el fichero una vez completado.
Para esto tendrás que realizar los siguientes pasos:
Definición de responsable por departamento
En el menú Calendarios, seleccionando el botón Gestionar Calendarios y la opción Configuración de importación. Aquí nos aparecerá un listado con los diferentes departamentos y podremos seleccionar el usuario que podrá exportar e importar el documento.

El usuario que definas como responsable tendrá acceso a descargar la plantilla para definir los horarios de los empleados del departamento y posteriormente realizar la importación de los mismos.
Puedes ver cómo se realiza la importación de calendarios AQUI.